马尾藻海中的拟菌病毒近亲
种群与进化
2007-05-23 v1
摘要
Acanthamoeba polyphaga拟菌病毒(已知最大的DNA病毒)的发现和基因组分析挑战了关于病毒的许多公认教条。其颗粒大小(>400 nm)、基因组长度(120万碱基对)和庞大的基因库(911个蛋白质编码基因)都模糊了病毒与最小寄生细胞生物之间的既定界限。系统发育分析还表明,拟菌病毒谱系可能出现在细胞生物从三个既定域分化之前,引发了一场只能通过生成和分析更多数据来解决的辩论。下一步是寻找证据表明拟菌病毒不是其种类的唯一代表,并确定在哪里寻找新的拟菌病毒科。对所有拟菌病毒预测蛋白与所有公开可用序列的详尽相似性搜索,在马尾藻海环境序列中识别出许多其最接近的同源物。随后的系统发育分析表明,在马尾藻海中存在大量未知的大型病毒,它们在进化上比任何目前已知的物种更接近拟菌病毒。它们的分离和基因组测序可能对理解大型DNA病毒的起源和多样性具有不可估量的价值,并有助于阐明它们最终在真核生物出现中所扮演的角色。
引用
@article{arxiv.q-bio/0504014,
title = {Mimivirus Relatives in the Sargasso Sea},
author = {Elodie Ghedin and Jean-Michel Claverie},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0504014},
year = {2007}
}
备注
see also http://www.giantvirus.org