拟菌病毒基因启动子在所有真核生物中表现出前所未有的保守性
基因组学
2016-08-16 v2
摘要
对最近测序的Acanthamoeba polyphaga拟菌病毒（已知最大的双链DNA病毒）基因组的初步分析预测，其蛋白质组的规模和复杂性更类似于小型寄生细菌，而非其他核质大DNA病毒，并确定了病毒中从未描述过的众多功能。有人提出，拟菌病毒谱系可能出现在细胞生物从生命三域中分化出来之前。对所有已知病毒基因组非编码部分的详尽计算机分析，现在揭示了AAAATTGA基序在近50%的拟菌病毒基因中前所未有的完美保守性。该基序优先出现在从预测的前导链转录的基因中，并与病毒感染周期早期所需的功能相关，如转录和蛋白质翻译。与单细胞真核生物（特别是阿米巴原生生物）已知启动子的比较强烈表明，AAAATTGA基序是TATA盒核心启动子元件的结构等价物。该元件是拟菌病毒谱系特有的，可能对应于真核生物界分化之前的祖先启动子结构。核心启动子区域这种前所未有的保守性是拟菌病毒的另一个特殊特征，再次引发了对其进化起源的疑问。
引用
@article{arxiv.q-bio/0504012,
title = {Mimivirus Gene Promoters Exhibit an Unprecedented Conservation among all Eukaryotes},
author = {Karsten Suhre and Stéphane Audic and Jean-Michel Claverie},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0504012},
year = {2016}
}