X染色体失活中X染色体配对的力学与动力学
基因组学
2009-10-14 v1 亚细胞过程
摘要
在X染色体失活（雌性哺乳动物细胞平衡X产物与雄性细胞的关键过程）启动时，X染色体沿其Xic（X失活中心）区域共定位。然而，诱导X染色体识别与配对的机制仍不清楚。基于近期关于分子因子及所涉DNA序列（即所谓的“配对位点”）的发现，我们利用统计物理学模型剖析了Xic共定位的力学基础。我们证明，可溶性DNA特异性结合分子（如实验所鉴定的）确实足以诱导同源染色体的自发共定位，但仅当其浓度或化学亲和力超过阈值时，这是热力学相变的结果。我们推导了配对的概率及其概率分布。染色体动力学分为两个阶段：初始的独立布朗扩散，随后在特征时间尺度后进入识别与配对。最后，我们研究了配对位点区域DNA缺失/插入的影响，并将模型预测与现有实验数据进行了比较。
引用
@article{arxiv.0910.2436,
title = {Mechanics and Dynamics of X-Chromosome Pairing at X Inactivation},
author = {A. Scialdone and M. Nicodemi},
journal= {arXiv preprint arXiv:0910.2436},
year = {2009}
}