分化与基因调控的数学方法
分子网络
2007-05-23 v1
摘要
我们考虑了基因网络建模提出的一些数学问题。基因的表达受一组复杂的调控控制，这通常用相互作用图来符号化描述。一旦建立了这样的图，仍然存在一个困难的任务，即在缺乏关于其调控的精确定量数据的情况下，决定可以从图中推断出基因网络的哪些动态特性。在本文中，我们讨论了R. Thomas提出的一个规则，根据该规则，网络具有多个稳态的可能性意味着相应相互作用图中存在正回路。我们证明，当以严谨的术语适当表述时，该规则成为一个定理，适用于几种不同类型的基因网络形式模型。这个结果对于微分或布尔类型的模型是已知的。我们表明，在微分设置中，当考虑蛋白质浓度的衰减时，该定理的一个更强版本成立。这使我们能够在分段线性模型和相应的离散模型中验证Thomas规则的有效性。我们也讨论了开放问题。
引用
@article{arxiv.q-bio/0510027,
title = {Mathematical approaches to differentiation and gene regulation},
author = {C. Soulé},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0510027},
year = {2007}
}
备注
To appear in Notes Comptes-Rendus Acad. Sc. Paris, Biologie