超越GWAS:定位家畜QTL的替代方法
基因组学
2015-04-16 v1
摘要
超越GWAS:在家畜中定位QTL的替代方法。本文提出了两种可用作标准GWAS替代方案的QTL定位方法。第一种依赖于动物群体(例如病例与对照)中纯合片段(ROH)频率的差异,第二种源于用于预测突变携带者的重采样技术,并基于多态性(SNP)在预测模型中的纳入频率。ROH被应用于荷斯坦-弗里生牛繁殖疾病的检测,而重采样被应用于布朗瑞士牛中BH2单倍型携带者的检测。这些替代方法可补充GWAS分析,以更准确地定位家畜中感兴趣性状的QTL。
引用
@article{arxiv.1504.03802,
title = {M\'as all\'a del GWAS: alternativas para localizar QTLs},
author = {Filippo Biscarini and Stefano Biffani and Alessandra Stella},
journal= {arXiv preprint arXiv:1504.03802},
year = {2015}
}
备注
5 pages, 3 figures, article in Spanish with abstract both in Spanish and English