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少即是多:以数据驱动清洗在 fMRI 中平衡降噪与数据保留

应用统计 2023-03-06 v4

摘要

功能磁共振成像 (fMRI) 数据中的伪影会导致对常见分布假设的偏离,引入空间和时间离群值,并降低数据的信噪比——这些都可能对下游统计分析产生负面影响。清洗 (scrubbing) 是一种排除被认为受伪影污染 fMRI 体积的技术,通常有两种类型。基于被试头部运动衍生度量的运动清洗很流行,但存在若干缺陷,尤其是单个体积和整个被试的高剔除率。 alternatively,像 DVARS 这样的数据驱动清洗方法基于处理后的 fMRI 时间序列中观测到的噪声,可能避免其中一些问题。在此我们提出“投影清洗 (projection scrubbing)”,一种基于统计离群值检测框架和策略性降维(包括独立成分分析 (ICA))以隔离伪影变异的新型数据驱动清洗方法。我们对运动清洗与数据驱动的投影清洗及 DVARS 进行了全面比较。我们认为,清洗成功的适当度量是:在典型功能连接基准上性能合理的前提下实现最大数据保留。我们发现,严格的运动清洗导致效度变差、信度变差,并对指纹识别仅有微小改进。与此同时,数据驱动清洗方法往往对指纹识别带来更大改进,且通常不会使效度或信度恶化。然而重要的是,与运动清洗相比,数据驱动清洗剔除的体积或整个 session 的比例更小。数据驱动 fMRI 清洗在不负面影响下游分析质量的情况下改善数据保留的能力,对群体神经科学研究的样本量具有重大意义。

关键词

引用

@article{arxiv.2108.00319,
  title  = {Less is more: balancing noise reduction and data retention in fMRI with data-driven scrubbing},
  author = {Damon Pham and Daniel McDonald and Lei Ding and Mary Beth Nebel and Amanda Mejia},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2108.00319},
  year   = {2023}
}

备注

74 pages