TKF91 模型下祖先序列、谱系和突变率的联合可辨识性
种群与进化
2024-11-15 v2 概率论
统计理论
统计理论
摘要
我们考虑在带有插入和删除（indel）的 DNA 序列演化模型中，联合辨识祖先序列、谱系和参数的问题。在 TKF91 模型的经典框架下，我们获得了关于根序列、叶子序列两两距离以及 indel 和突变比例率的显式公式，这些公式基于任意谱系下叶子序列分布。这些显式公式不仅强化了现有可逆性结果，适用于非超音序列的谱系，还导致新的估计器，其假设条件比现有文献更少。我们的仿真研究表明，随着独立样本数的无限增长，这些估计器在统计上是一致的。
引用
@article{arxiv.2410.09620,
title = {Joint identifiability of ancestral sequence, phylogeny and mutation rates under the TKF91 model},
author = {Alex Xue and Brandon Legried and Wai-Tong Louis Fan},
journal= {arXiv preprint arXiv:2410.09620},
year = {2024}
}