利用单分子定位显微镜研究黏着斑的内部结构
生物物理
2017-05-24 v1
摘要
细胞依靠黏着斑来完成多种重要任务，包括运动、环境感知以及与细胞外基质的黏附。尽管对黏着斑进行基本表征是一个引人注目的目标，但其高度的复杂性和低于衍射极限的微小尺寸阻碍了对其的全面理解。在本研究中，我们使用单分子定位显微镜（SMLM）研究了在两种不同的细胞外基质代表性基底（即纤连蛋白包覆的基底和特定生物功能化的纳米图案化基底）上生长的大鼠胚胎成纤维细胞中的整合素 3 和桩蛋白。为了量化黏着斑的亚结构，我们开发了一种基于高斯混合期望最大化的方法，该方法考虑了定位不确定性和背景。对我们的 SMLM 数据的分析表明，黏着斑内被表征为高斯混合的结构通常面积在 0.01 到 1 m 之间，包含 10 到 100 个定位，并且可能表现出显著的偏心率。我们基于 SMLM 的方法为研究在大小、形状和密度上表现出显著多样性的分子组装体的结构和功能生物学开辟了新途径。
引用
@article{arxiv.1705.08107,
title = {Investigating the inner structure of focal adhesions with single-molecule localization microscopy},
author = {Hendrik Deschout and Ilia Platzman and Daniel Sage and Lely Feletti and Joachim P. Spatz and Aleksandra Radenovic},
journal= {arXiv preprint arXiv:1705.08107},
year = {2017}
}