家鼠基因组多样性的种间渐渗起源
种群与进化
2014-09-22 v2
摘要
我们报告了一项针对家鼠（Mus musculus domesticus）的全基因组渐渗扫描研究，涉及阿尔及利亚鼠（Mus spretus），样本取自非洲和欧洲的同域分布区和异域分布区。我们的分析揭示了渐渗特征沿基因组以及跨样本的广泛变异性。我们发现，每个基因组中少于一半的常染色体包含所有可检测到的渐渗，而 X 染色体则完全没有。此外，欧洲小鼠携带的 M. spretus 等位基因多于同域的非洲小鼠。利用跨样本渐渗基因组片段的长度分布和共享模式，我们推断：首先，至少发生了三次涉及 M. spretus 的不同杂交事件，其中一次是古老的，另外两次是近期的（其中一次推测是由于杀鼠剂华法林的选择压力所致）；其次，几个推断出的渐渗片段包含可能赋予适应性优势的基因；第三，渐渗片段可能包含决定这些片段进化命运的驱动基因。此外，功能分析揭示了渐渗基因中对适应度至关重要的基因，包括与杀鼠剂抗性有关的 Vkorc1 基因以及嗅觉受体基因。我们的发现突显了渐渗在自然界中的广泛程度和作用，并呼吁在进化和遗传研究中谨慎分析和解读家鼠数据。
引用
@article{arxiv.1311.5652,
title = {Interspecific Introgressive Origin of Genomic Diversity in the House Mouse},
author = {Kevin J. Liu and Ethan Steinberg and Alexander Yozzo and Ying Song and Michael H. Kohn and Luay Nakhleh},
journal= {arXiv preprint arXiv:1311.5652},
year = {2014}
}