基于稀有进化事件知识的系统发育树推断
离散数学
2017-06-15 v2 定量方法
摘要
作为潜在的同型性极低的性状，稀有事件在分子系统发育学中发挥着日益重要的作用。在本文中，我们通过考虑由分离两个分类单元的单一事件的存在所定义的分类单元集合上的二元关系，从组合角度分析了系统发育信息内容。我们证明该关系的图表示必定是一棵树。此外，我们完全刻画了此类关系的树与底层系统发育树之间的关系。考虑到诸如串联重复随机丢失事件等有向操作，我们论证了非对称信息如何约束部分重建的系统发育中根的位置。
引用
@article{arxiv.1612.09093,
title = {Inference of Phylogenetic Trees from the Knowledge of Rare Evolutionary Events},
author = {Marc Hellmuth and Maribel Hernandez-Rosales and Yangjing Long and Peter F. Stadler},
journal= {arXiv preprint arXiv:1612.09093},
year = {2017}
}