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马尔可夫序列中最大区段得分分布的改进

概率论 2018-03-08 v1

摘要

(Ai)i0(A_i)_{i \geq 0} 为有限状态不可约非周期 Markov 链,ff 为格点得分函数,其平均得分为负但可能取正得分。定义 S0:=0S_0:=0Sk:=i=1kf(Ai)S_k:=\sum_{i=1}^k f(A_i) 为连续部分和,S+S^+ 为最大非负部分和,Q1Q_1 为首次非负游程的最大区段得分,Mn:=max0kn(SSk)M_n:=\max_{0\leq k\leq\ell\leq n} (S_{\ell}-S_k) 为 Karlin 和 Altschul(1990)首次定义的局部得分。我们建立了 S+S^+ 精确分布的递推公式,并推导了 Q1Q_1MnM_n 分布的新近似。在一个简单应用案例中给出了计算方法,并将这些新近似与 Karlin 和 Dembo(1992)提出的近似进行比较,以评估改进。

关键词

引用

@article{arxiv.1803.02769,
  title  = {Improvements on the distribution of maximal segmental scores in a Markovian sequence},
  author = {Simona Grusea and Sabine Mercier},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1803.02769},
  year   = {2018}
}