iMet：一种基于串联质谱对未知代谢物进行结构注释的计算工具
定量方法
2017-03-17 v1 分子网络
摘要
非靶向代谢组学研究揭示了大量天然存在的代谢物，由于其化学结构和 MS/MS 谱图 unavailable 于数据库中而无法被表征。在此，我们推出 iMet，这是一种基于实验串联质谱的计算工具，有可能实现对先前未发现代谢物的注释。iMet 利用 MS/MS 谱图识别与未知代谢物结构相似的代谢物，并给出将已知代谢物转化为未知代谢物的净原子增减。我们用 148 种代谢物验证了该算法，结果显示对于其中 89% 的代谢物，iMet 识别出的前四个匹配中至少有一个能实现对未知代谢物的正确注释。iMet 可免费获取，网址为 http://imet.seeslab.net。
引用
@article{arxiv.1607.04122,
title = {iMet: A computational tool for structural annotation of unknown metabolites from tandem mass spectra},
author = {Antoni Aguilar-Mogas and Marta Sales-Pardo and Miriam Navarro and Ralf Tautenhahn and Roger Guimerà and Oscar Yanes},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.04122},
year = {2017}
}
备注
21 pages, 6 figures