从分子量分布的矩差异推断代谢速度
定量方法
2024-09-18 v4 生物大分子
细胞行为
分子网络
亚细胞过程
摘要
代谢通路是生物化学中的基本图谱,详细描述了分子如何通过各种反应进行转化。代谢网络的复杂性——其中单个化合物可能参与多条通路——给推断代谢平衡随时间或不同处理后的变化带来了挑战。同位素标记实验是推断代谢通量的标准方法,代谢通量目前定义为单个代谢物在给定通路中随时间流动的量。然而,目前仍没有方法能准确推断实验中不同处理后的代谢平衡变化。本研究引入了一个不同的概念:分子量分布,即所有感兴趣代谢物分子量的经验分布。通过估计这些分布的位置和尺度估计的差异,即使不需要知道这些化合物及其相关通路的精确化学结构,也能定量推断代谢平衡的变化。本研究为经典生物学概念提供了数学框架。
引用
@article{arxiv.2402.14887,
title = {Infer metabolic velocities from moment differences of molecular weight distributions},
author = {Li Tuobang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2402.14887},
year = {2024}
}