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在粗粒化疏水 - 极性肽模型中识别特征蛋白质折叠通道

软凝聚态物质 2009-11-13 v1

摘要

基于极简的非格点粗粒化模型,讨论了疏水 - 极性杂聚物的折叠通道和自由能景观。我们研究了杂聚物序列中疏水和极性单体的重排如何导致完全不同的折叠行为。通过研究具有相同疏水和极性残基含量的三个示例序列,我们可以在这一简单模型中重现二态折叠、经由中间体的折叠以及亚稳态。

关键词

引用

@article{arxiv.0710.4927,
  title  = {Identification of Characteristic Protein Folding Channels in a Coarse-Grained Hydrophobic-Polar Peptide Model},
  author = {Stefan Schnabel and Michael Bachmann and Wolfhard Janke},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0710.4927},
  year   = {2009}
}

备注

26 pages, 6 figures