DNA 微阵列的杂交等温线与突变研究的定量化

背景：用于检测作为癌症标志物的点突变的诊断性 DNA 阵列通常在野生型 DNA 大量过剩的情况下工作。该过剩可因野生型靶标在突变点处的竞争杂交而导致假阳性。DNA 阵列数据的分析通常是定性的，旨在确定特定点突变的存在与否。我们的理论方法给出了量化分析的方法，从而获得突变与野生型 DNA 的浓度比。方法：该理论以杂交等温线表述，将点上杂交分数与热力学平衡时样品溶液的组成相关联。它聚焦于含单链 DNA 过剩的样品及低表面探针密度的 DNA 阵列。杂交平衡常数可由最近邻法获得。结果：两种途径使我们能从 DNA 阵列数据获得定量结果。其一将突变点信号与野生型点信号比较，实施需知两点饱和强度。其二需比较突变点在不同温度下的强度，此时未必总需知饱和信号。结论：DNA 阵列可用于在体细胞点突变研究中获得突变 DNA 与野生型 DNA 浓度比的定量结果。