HiTRACE-Web：用于高通量毛细管电泳稳健分析的在线工具
定量方法
2015-02-10 v2
摘要
为促进大规模高通量毛细管电泳数据的分析，我们此前提出了一套名为 HiTRACE（High Throughput Robust Analysis of Capillary Electrophoresis，高通量毛细管电泳稳健分析）的高效分析软件。HiTRACE 已广泛用于 RNA 和 DNA 结构映射实验的数据定量，包括突变与图谱接触推断、染色质足迹分析、EteRNA RNA 设计项目以及其他高通量应用。然而，HiTRACE 基于一套命令行 MATLAB 脚本，需要用户付出相当大的努力来学习、使用和扩展。在此，我们推出 HiTRACE-Web，这是 HiTRACE 的在线版本，不仅包含此前命令行版本中的标准功能，还增加了自动条带标注和灵活调整标注等额外功能，所有操作均通过用户友好的环境完成。利用并行化处理，该在线工作流也比大多数用户在本地计算机上可用的软件实现更快。免费访问地址：http://hitrace.org
引用
@article{arxiv.1305.3507,
title = {HiTRACE-Web: an online tool for robust analysis of high-throughput capillary electrophoresis},
author = {Hanjoo Kim and Pablo Cordero and Rhiju Das and Sungroh Yoon},
journal= {arXiv preprint arXiv:1305.3507},
year = {2015}
}