PepSIRF：用于分析高通量 DNA 条形码肽检测数据的灵活而全面的工具
定量方法
2020-07-13 v1 基因组学
摘要
通过将肽与 DNA 标签（即“条形码”）偶联，现在可以利用高通量测序（HTS）技术实现高度多重化的基于肽的检测，其具有多种潜在应用，包括对抗体的表位进行广泛表征。虽然一般而言 HTS 数据的处理已得到良好支持，但专为这些高度多重化肽检测所生成数据开发的软件工具极少。为填补这一空白，我们推出 PepSIRF（Peptide-based Serological Immune Response Framework，基于肽的血清学免疫应答框架），这是一个灵活且全面的软件包，专为分析来自高度多重化基于肽的检测的 HTS 数据而设计。
引用
@article{arxiv.2007.05050,
title = {PepSIRF: a flexible and comprehensive tool for the analysis of data from highly-multiplexed DNA-barcoded peptide assays},
author = {Zane W. Fink and Vidal Martinez and John Altin and Jason T. Ladner},
journal= {arXiv preprint arXiv:2007.05050},
year = {2020}
}
备注
5 pages, 1 figure