由四个水分子稳定的甘氨酸两性离子
化学物理
2019-03-20 v2
摘要
我们进行了平面波密度泛函理论计算,以考察中性甘氨酸(GlyNE)及其两性离子(GlyZW)被最多四个水分子溶剂化时的势能面。我们之前对Gly的构象研究表明,常用的局域基函数组在处理高能异构体(如Gly)时存在不足。我们发现GlyNE和GlyZW的势能面比通常认为的更平滑,且没有许多局域极小。两个水分子可在GlyZW周围产生一个局域极小。有三个水分子时,GlyNE与GlyZW之间的能量差减小到仅27 meV,从GlyNE出发的能垒为115 meV。当被四个水分子溶剂化时,GlyZW在能量上稳定122 meV。水分子在互变异构中成为催化剂,有时参与质子在水桥上的切换转移。我们的结果与实验发现一致,即Gly的有效水合数为3~4。
引用
@article{arxiv.1712.05542,
title = {Glycine Zwitterion Stabilized by Four Water Molecules},
author = {Byeong June Min},
journal= {arXiv preprint arXiv:1712.05542},
year = {2019}
}
备注
4 Figures https://link.springer.com/content/pdf/10.3938%2Fjkps.74.324.pdf