水相中谷氨酸内异构质子转移的ab initio分子动力学研究
软凝聚态物质
2009-11-11 v1
摘要
我们使用ab initio分子动力学模拟来定量化一种模型质子转移反应的结果，该反应将稳定于气相的中性谷氨酸分子转化为在水溶液中占主导地位的锌离子体。我们计算了与谷氨酸中直接内异构质子转移事件相关的平均势。结构分析表明，谷氨酸的平均水化数Nw在反应坐标上并非恒定，而是从中性分子中的Nw=5，逐渐过渡到锌离子体中的Nw=8。我们报告了中性和带电谷氨酸分子之间的自由能差，以及质子转移的自由能垒。最后，我们确定了方法中固有的近似，并估计了对我们报告的热力学预测相应的校正。
关键词
引用
@article{arxiv.cond-mat/0503301,
title = {Ab initio Molecular Dynamics Study of Glycine Intramolecular Proton Transfer in Water},
author = {Kevin Leung and Susan B. Rempe},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0503301},
year = {2009}
}
备注
14 pages, 10 figures, to appear in J. Chem. Phys