由传播前沿介导的微生物基因组序列全局分化
基因组学
2009-11-11 v3
摘要
我们对微生物基因组中重组与点突变之间的竞争进行建模,并提出存在两个不同阶段的证据:一个阶段是均匀的,另一个阶段具有遗传多样性。根据同源重组的具体特征,我们发现全局序列分化可由沿基因组传播的前沿所介导,阐明了其在基因组结构上的特征性标志,且显然在密切相关的芽孢杆菌(Bacillus)菌株中被观察到。前沿传播为微生物“物种形成”提供了一种涌现的、通用的机制,并建议基于微生物支持传播前沿的倾向性对其进行分类。
引用
@article{arxiv.q-bio/0501033,
title = {Global divergence of microbial genome sequences mediated by propagating fronts},
author = {Kalin Vetsigian and Nigel Goldenfeld},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0501033},
year = {2009}
}