基因组：处于具有最大信息容量的混沌边缘
基因组学
2007-08-14 v1
摘要
我们提出了一个有序度指数 phi，用于量化应用于基因组序列时的“生命处于混沌边缘”这一概念。它将基因组映射为从 0（随机且长度无限）到 1（完全有序）的一个数值，且适用于任意序列长度。研究发现 GenBank 中的 786 个完整基因组序列的 phi 值处于一个非常狭窄的范围内：0.037+/-0.027。我们表明这意味着基因组处于完全随机的中途，即处于混沌边缘。我们论证这一狭窄范围代表了序列空间中的一个不动点邻域，而基因组是由一个稳健的、主要为中性的进化过程动力学驱动至此的。
引用
@article{arxiv.0708.1598,
title = {Genomes: at the edge of chaos with maximum information capacity},
author = {Sing-Guan Kong and Hong-Da Chen and Wen-Lang Fan and Jan Wigger and Andrew Torda and HC Lee},
journal= {arXiv preprint arXiv:0708.1598},
year = {2007}
}
备注
4 pages, 3 figures, paper