GemTools:一种快速高效的遗传祖先估计方法
应用统计
2011-04-07 v1
摘要
为了揭示复杂疾病的遗传基础,通常会在全基因组范围内测量大量遗传变异(通常是SNP)。GemTools提供了基于SNP基因型对遗传祖先进行建模的计算高效工具。其主要算法基于遗传相似性创建特征映射,然后根据映射位置对受试者进行聚类。该过程迭代进行,直到每个聚类相对同质。对于遗传关联研究,GemTools基于遗传相似性匹配病例和对照。
引用
@article{arxiv.1104.1162,
title = {GemTools: A fast and efficient approach to estimating genetic ancestry},
author = {Lambertus Klei and Brian P. Kent and Nadine Melhem and Bernie Devlin and Kathryn Roeder},
journal= {arXiv preprint arXiv:1104.1162},
year = {2011}
}
备注
5 pages, 1 figure