功能性剪接网络揭示核心剪接体机制的广泛调控潜能
分子网络
2015-01-19 v2 基因组学
摘要
Pre-mRNA剪接依赖于剪接体中超过150种蛋白质组件之间知之甚少的动态相互作用。剪接可在哪些步骤受到调控仍 largely 未知。我们系统分析了敲低剪接机制组件对与细胞增殖和凋亡相关的可变剪接事件的影响，并利用此信息重构了功能性相互作用网络。该网络准确捕捉了已知的物理与功能关联并识别出新的关联，揭示了核心剪接体组件与它们在剪接体组装过程中招募顺序和持续时间相关的显著调控潜能。与剪接位点识别早期步骤调控的标准模型相反，参与剪接体催化激活的因子表现出调控特性。该网络还阐明了hnRNP C与U2AF之间的拮抗作用以及抗肿瘤药物的靶点，并可广泛用于识别剪接调控机制。
关键词
引用
@article{arxiv.1412.2390,
title = {Functional Splicing Network Reveals Extensive Regulatory Potential of the Core Spliceosomal Machinery},
author = {Panagiotis Papasaikas and J. Ramon Tejedor and Luisa Vigevani and Juan Valcarcel},
journal= {arXiv preprint arXiv:1412.2390},
year = {2015}
}
备注
Main text 17 pages + Supplementary Information 23 pages v2 added missing pdf metadata