基于稳态光阱数据的分子马达力依赖脱附速率
生物物理
2019-03-18 v2 亚细胞过程
摘要
分子马达沿丝状结构行走,直至以力依赖的脱附速率随机脱离。本文表明,该脱附速率可通过分析处于稳态光阱中运动的分子马达的实验数据获得。我们提出两种互补方法,分别基于对脱附力分布和马达受力轨迹的分析。第一种方法利用解析导出的滑移键、滑移-理想键和捕获键的力分布来拟合脱附力的累积分布。第二种方法基于对观测受力轨迹的统计分析。我们用随机模拟验证了两种方法,并将其应用于驱动蛋白-1(kinesin-1)的实验数据。
引用
@article{arxiv.1806.07865,
title = {Force-dependent unbinding rate of molecular motors from stationary optical trap data},
author = {Florian Berger and Stefan Klumpp and Reinhard Lipowsky},
journal= {arXiv preprint arXiv:1806.07865},
year = {2019}
}