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分子马达吸附并驱动的半柔性聚合物的受迫脱附

生物物理 2016-02-12 v3 软凝聚态物质 统计力学 亚细胞过程

摘要

我们构建并表征了一个模型,用于描述半柔性聚合物在存在活性时的动力学,这种活性源于不可逆附着在基底上的马达蛋白以及作用于细丝一端的横向拉力。马达蛋白的随机结合 - 解离及其沿聚合物移动的能力产生了主动力。当拉力达到阈值时,聚合物最终从基底脱附。通过在朗之万热浴和随机马达活性存在的情况下对聚合物进行分子动力学模拟,我们获得了脱附相图。脱附分数波动的关联时间随着接近完全脱附而增加,这一现象通过幂律谱密度进行了定量捕捉。我们利用聚合物弱弯曲极限下的平均场近似并进行线性稳定性分析,对相图进行了理论分析。该分析预测脱附力随聚合物弯曲刚度、马达蛋白的主动速度和持续性的增加而增加,从而捕捉到了模拟结果的主要特征。

关键词

引用

@article{arxiv.1411.2782,
  title  = {Forced desorption of semiflexible polymers, adsorbed and driven by molecular motors},
  author = {Abhishek Chaudhuri and Debasish Chaudhuri},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1411.2782},
  year   = {2016}
}

备注

9 pages, 7 figures