表面相互作用对半柔性链折叠与受迫解链的影响
软凝聚态物质
2007-05-23 v1
摘要
我们利用理论和模拟研究了吸附半柔性聚合物链的折叠和受迫解链转变。这些过程描述了包括蛋白质间粘附相互作用和受体与细胞壁连接在内的生物相关现象。结合界面被建模为固体表面,半柔性链采用蠕虫链模型。利用Langevin模拟,我们考察了在表面与聚合物链之间存在吸引相互作用时,球拍状和环状结构的排序动力学。对于一系列相互作用、温度和持久长度l_p,我们获得了所有相关形态的单体密度分布n(x)。n(x)的模拟结果与理论吻合良好。表面上环状结构的形成表现为一级相变。通过施加拉力f来探测链-表面相互作用。平均延伸x作为f的函数呈现S形曲线,在解链力f_c处出现尖锐的全或无转变,f_c随结构有序度的增加而增大。模拟的x与理论预测吻合良好。在固定温度下,临界力f_c是l_s/l_c的函数,其中l_c和l_s分别是表征分子内和链-表面吸引强度的长度尺度。对于固定的l_s,f_c随l_p的减小而增大。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0509657,
title = {Influence of surface interactions on folding and forced unbinding of semiflexible chains},
author = {V. Barsegov and D. Thirumalai},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0509657},
year = {2007}
}
备注
26 pages, 6 figures, accepted to J. Phys. Chem. B