异质轨道上有限持续度分子马达的动力学
统计力学
2009-11-10 v1 生物大分子
摘要
本文考虑了偶尔从DNA或RNA等异质轨道上脱离的分子马达的动力学。受近期单分子实验的启发,我们研究了一个简单的模型:分子马达利用化学能沿无序轨道移动,同时外部力阻碍其运动。分子马达还具有有限持续度,即它们可以以位置依赖的速率离开轨道。我们表明,系统对脱离速率无序的响应取决于外部力的值。对于大多数外部力的值,强无序导致在轨道上长时间存活的分子马达局域在优先位置。然而,在停滞力附近,任何程度的无序都会导致局域化。能带顶部局域态的存在意味着对存活概率衰减的拉伸指数贡献。为了获得这些结果,我们研究了时间演化算符的复本征值谱。类似的谱分析也为研究具有无限持续度的马达动力学提供了一种非常有效的方法。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0409198,
title = {Dynamics of Molecular Motors with Finite Processivity on Heterogeneous Tracks},
author = {Yariv Kafri and David K. Lubensky and David R. Nelson},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0409198},
year = {2009}
}
备注
19 Pages, 21 Figures