分子运动器通过 compartments 的边界-体相互作用
统计力学
2007-05-23 v1 软凝聚态物质
生物物理
亚细胞过程
摘要
在纤维轨道上的运动蛋白质流动被建模为格子驱动扩散系统。将运动器视为跳跃粒子，它们在结合到纤维时执行高度偏好的非对称排除过程。以一定速率，它们从纤维上脱落，执行无偏随机游走， bulk 被考虑为一个封闭的立方体 compartment。运动器从纤维沿对称轴的 leftmost (rightmost) 站点注入(抽取)。我们探讨了该系统的传输性质，研究了 bulk-boundary 相互作用对系统平稳态的影响。我们指出，脱落速率显著影响系统性质。特别是且与 ASEP 不同，指出结合粒子的密度轮廓在脱落速率变化时表现出不同类型的非单调行为。我们指出在某些情况下，纤维的密度轮廓由高密度和低密度区域组成。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0512009,
title = {Boundary-bulk interplay of molecular motor traffic flow through a compartment},
author = {M. Ebrahim Fouladvand and Modjtaba Salehi and Mostafa Yadegari},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0512009},
year = {2007}
}
备注
9 pages, 17 eps figures, Revtex