DNA弯曲蛋白对缠结物的流化作用
软凝聚态物质
2025-02-03 v3
摘要
尽管在纳米尺度和单分子层面对核相关蛋白（NAPs）如何与DNA相互作用已有深入认识，但它们在调节体内缠结基因组的介观粘弹性方面的作用迄今被忽视。通过结合微流变学与分子动力学模拟，我们发现一种重要的NAP——整合宿主因子（IHF）——在生理浓度和化学计量比下将缠结的DNA的粘度降低了20倍。我们认为IHF可能充当“基因组流化剂”，将核区的有效粘度降低约200倍。我们的结果表明IHF在调节体内DNA动力学与重组中扮演了此前未被认识的关键角色。
引用
@article{arxiv.2205.03510,
title = {Fluidification of entanglements by a DNA bending protein},
author = {Yair A. G. Fosado and Jamieson Howard and Simon Weir and Agnes Noy and Mark C Leake and Davide Michieletto},
journal= {arXiv preprint arXiv:2205.03510},
year = {2025}
}