通过形成老化微凝胶的转录因子调控DNA流变学
软凝聚态物质
2025-12-03 v1 其他凝聚态物理
生物物理
计算物理
生物大分子
摘要
蛋白质和核酸形成具有复杂流变学性质的非牛顿液体，这些性质有助于其在体内的功能。在这里，我们研究了转录因子NANOG的流变学，NANOG是维持胚胎干细胞自我更新的关键蛋白质。我们发现，在高浓度下NANOG通过其固有的无序色氨酸富集域形成宏观老化凝胶。通过结合分子动力学模拟、质量光度法和冷冻电镜（Cryo-EM），我们还发现NANOG形成自限性类微胶束簇，暴露出其DNA结合域。在密集的DNA溶液中，NANOG类微胶束结构稳定了分子间纠缠和交联，形成类微凝胶结构。我们的发现表明NANOG可能以一种非传统方式有助于调控基因表达：通过形成老化类微凝胶结构来限制和稳定关键转录位点处的基因组动力学，可能在基因网络中实现机械记忆。
引用
@article{arxiv.2512.02864,
title = {Modulation of DNA rheology by a transcription factor that forms aging microgels},
author = {Amandine Hong-Minh and Yair Augusto Gutiérrez Fosado and Abbie Guild and Nicholas Mullin and Laura Spagnolo and Ian Chambers and Davide Michieletto},
journal= {arXiv preprint arXiv:2512.02864},
year = {2025}
}