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基于流动的秀丽隐杆线虫连接组网络分析

神经元与认知 2016-08-09 v3 物理与社会

摘要

我们利用线虫 Caenorhabditis elegans 有向神经元网络上的流动传播,揭示其连接组中动态相关的特征。我们发现了不同粒度层级上基于神经元的流动分组,并将其与该神经系统的功能和解剖组成部分相联系。对全套单神经元和双神经元消融进行系统的计算机(in silico)评估,用于识别引起多分辨率流动结构最严重破坏的删除。此类消融与功能相关神经元相关联,并为进一步的体内(in vivo)研究提出了潜在候选。此外,我们利用各尺度上流入和流出网络流的定向模式,在不预先强加先验类别的情况下识别连接组中神经元的流动轮廓。所识别的四种流动角色与由生物输入-响应情景驱动的信号传播相关联。

关键词

引用

@article{arxiv.1511.00673,
  title  = {Flow-based network analysis of the Caenorhabditis elegans connectome},
  author = {Karol A. Bacik and Michael T. Schaub and Mariano Beguerisse-Díaz and Yazan N. Billeh and Mauricio Barahona},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1511.00673},
  year   = {2016}
}

备注

28 pages including Supplementary Information, 8 figures and 12 figures in the SI