有限相分离 FRET II:从模拟数据确定畴尺寸
软凝聚态物质
2011-06-01 v1 定量方法
摘要
我们建立了一个新模型,用于描述相分离双层膜中自由扩散膜探针间的 FRET 效率(E FRET),称为有限相分离 FRET(FP-FRET),原则上适用于相畴尺寸大于约 Ro 的任何体系。本文采用蒙特卡罗技术,针对一系列探针分配行为和畴尺寸模拟 E FRET,然后将模拟数据拟合到 FP-FRET 模型以恢复模拟参数。我们发现,对于直径约 5Ro 以内的畴,FP-FRET 确定的畴尺寸与模拟值偏差在 5% 以内;对于直径约 20Ro 以内的畴,偏差在 15% 以内。我们还考察了该模型在特定模型假设不成立时的表现。
引用
@article{arxiv.1105.6254,
title = {Finite Phase-separation FRET II: Determination of domain size from simulated data},
author = {Frederick A. Heberle and Gerald W. Feigenson},
journal= {arXiv preprint arXiv:1105.6254},
year = {2011}
}
备注
50 pages, 8 figures, 1 appendix