利用分子密度泛函理论快速计算溶剂化自由能：热力学系综偏摩尔体积修正
软凝聚态物质
2014-06-12 v1
摘要
分子密度泛函理论 (MDFT) 提供了一种高效的隐式溶剂方法来估算分子溶剂化自由能，同时保留了溶剂的完整分子表示。即使在自由能泛函的二阶近似（即所谓的均匀参考流体近似）下，我们表明，针对 500 种有机化合物数据集计算得到的水合自由能，其质量与通过分子动力学自由能微扰模拟获得的结果相当，而计算成本降低了两个到三个数量级。这需要引入适当的偏体积修正，以便将结果从巨正则系综转换为与实验相关的等压 - 等温系综。我们表明，该修正可以扩展到 3D-RISM 计算中，从而为最近提出的经验偏摩尔体积修正提供了坚实的理论依据。
引用
@article{arxiv.1406.2847,
title = {Fast Computation of Solvation Free Energies with Molecular Density Functional Theory: Thermodynamic-Ensemble Partial Molar Volume Corrections},
author = {Volodymyr P. Sergiievskyi and Guillaume Jeanmairet and Maximilien Levesque and Daniel Borgis},
journal= {arXiv preprint arXiv:1406.2847},
year = {2014}
}
备注
Version with correct equation numbers is here: http://compchemmpi.wikispaces.com/file/view/sergiievskyi_et_al.pdf/513575848/sergiievskyi_et_al.pdf Supporting information available online at: http://compchemmpi.wikispaces.com/file/view/SuppInf_sergiievskyi_et_al_07-04-2014.pdf/513576008/SuppInf_sergiievskyi_et_al_07-04-2014.pdf