将组合调控网络建模扩展至包含活性控制与衰减调制
动力系统
2022-05-17 v2
摘要
理解系统内交互的结构如何影响系统动力学在许多科学领域都很重要。我们将网络动力学建模平台 DSGRN 扩展到新型交互,该平台将动力学与参数空间组合化以构建网络动力学的有限但准确的摘要。标准 DSGRN 假设每个网络边控制目标节点的丰度速率,而新边可控制其目标的活动水平或衰减速率。虽然受系统生物学中转录后修饰和泛素化过程的启发,我们的扩展适用于任何带符号有向网络的动力学。
引用
@article{arxiv.2111.01399,
title = {Extending combinatorial regulatory network modeling to include activity control and decay modulation},
author = {Bree Cummins and Marcio Gameiro and Tomas Gedeon and Shane Kepley and Konstantin Mischaikow and Lun Zhang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2111.01399},
year = {2022}
}