ExpressInHost：一种用于宿主微生物中重组蛋白表达的密码子调谐工具
生物物理
2022-11-01 v2
摘要
ExpressInHost (https://gitlab.com/a.raguin/expressinhost) 是一个基于 GTK/C++ 的用户友好图形界面，可用于为宿主微生物中的重组蛋白表达调谐 mRNA 的密码子序列。异源基因表达在生物技术公司和学术研究实验室中被广泛采用。然而，重组蛋白的表达可能具有挑战性。一方面，最大化翻译速度很重要，尤其在生物技术公司相关的可规模化生产过程中；但另一方面，由此常出现溶解性问题，因为翻译“暂停”可能是让新生多肽链适当折叠的关键。为应对这一挑战，我们开发了一款软件，利用遗传密码的简并性提供三种不同模式来调谐密码子序列。所实现的调谐策略考虑了宿主及原生生物特定的 tRNA 资源。它们平衡了快速翻译与原生速度模拟，后者可能对实现正确蛋白折叠从而避免蛋白溶解性问题十分重要。
引用
@article{arxiv.2103.08365,
title = {ExpressInHost: A codon tuning tool for the expression of recombinant proteins in host microorganisms},
author = {AdélaïdeRaguin and Ian Stansfield and Maria Carmen Romano},
journal= {arXiv preprint arXiv:2103.08365},
year = {2022}
}