用于蛋白质逆翻译中基因组风格模仿的遗传算法
生物物理
2007-05-23 v1 定量方法
摘要
若干技术应用需要将蛋白质翻译为编码它的核酸（“逆翻译”）。遗传密码的简并性使该翻译存在歧义；且并非每种翻译都同等可行。该问题的常见解法是模仿目标物种的密码子使用偏好。本文讨论编码序列（“编码统计”）的其他若干特征，它们与不同物种的“基因组风格”相关。随后使用遗传算法通过最小化编码统计差异，获得模仿这些风格的逆翻译。文中讨论了可能的改进与应用。
引用
@article{arxiv.physics/0304016,
title = {Genetic Algorithms for the Imitation of Genomic Styles in Protein Backtranslation},
author = {Andres Moreira},
journal= {arXiv preprint arXiv:physics/0304016},
year = {2007}
}
备注
17 pages, 13 figures. Submitted to Theor. Comp. Science