分子对极端环境适应的证据及其对空间环境的适用性
天体物理学
2009-11-13 v1
摘要
这是一项关于负责微观生命适应极端地球环境的基因特征的初步研究。我们展示了关于 COG 簇鉴定的结果，这些 COG 簇为若干超嗜热菌所共有，而排除了嗜温菌 E.coli.K12 所共有的 COG 簇，这将产生一组可能参与极端温度下生命适应的蛋白质。产甲烷菌作为唯一具有能在 0C（M.frigidum 和 M.burtonii）和 110C（M.kandleri）下生长物种的生物群体而脱颖而出。并非所有热适应成分都可归因于新基因，被称为热休克蛋白的分子伴侣在高温下稳定了酶。在细菌和真核生物中发现的高度保守的分子伴侣并不存在于超嗜热古菌中，相反，它们具有一种独特的分子伴侣 TF55。我们的目标是使用我们专门为嗜极生物基因组比较分析而开发的软件，以搜索参与超嗜热菌适应的额外新基因。用于这些研究的超嗜热菌基因组已整合到我们的软件中，包括：M.jannaschii、M.kandleri、A.fulgidus 和 3 种 Pyrococcus 物种。当有信息可用时，共有基因根据其在细胞过程中的作用被注释和分组，并鉴定了以前未被认为与超嗜热菌热适应有关的蛋白质。为了更多地了解这些蛋白质，需要额外的实验数据。为了探讨非基因基础的热适应成分，对所有已测序的嗜极生物分析了其 GC 含量和氨基酸疏水性。我们开发了一个最适生长温度的预测模型。
引用
@article{arxiv.0804.4541,
title = {Evidence of molecular adaptation to extreme environments and applicability to space environments},
author = {M. D. Filipovic and S. Ognjanovic and M. Ognjanovic},
journal= {arXiv preprint arXiv:0804.4541},
year = {2009}
}
备注
6 pages, 1 figure, To be published in Serbian Astronomical Journal