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遍历性:隐藏偏差与增长率增益

定量方法 2018-04-18 v2

摘要

许多单细胞观测量具有高度异质性。这部分异质性源于与年龄相关的现象:即具有不同年龄的细胞呈非均匀分布。这引发了对解析方法的新兴趣,包括使用“von Foerster 方程”预测群体生长和细胞年龄分布。在此我们讨论该机制一些最流行的实现如何对细胞周期时长集合的遍历性施加强条件。我们表明,术语“遍历性”的一个常见定义“在多个世代中观察单个个体可概括整个集合的行为”在个体数固定的集合中被另一个定义“观测任何状态的概率随时间及所有个体保持守恒”所蕴含,但当集合处于增长时这不成立。我们进一步探讨了细胞周期时长间的世代相关性对群体增长率的影响。最后,我们在此背景下探讨了“增长率增益”——即细胞周期时长的变异导致群体水平增长率提升的现象。我们强调,根本上该效应源于不对称分裂。

关键词

引用

@article{arxiv.1706.09478,
  title  = {Erg(r)odicity: Hidden Bias and the Growthrate Gain},
  author = {Nash Rochman and Dan Popescu and Sean X. Sun},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1706.09478},
  year   = {2018}
}

备注

17 pages, 4 figures