刻画自然与合成 DNA 双螺旋结构的中心对称矩阵的可嵌入性
种群与进化
2022-11-09 v2 概率论
摘要
本文讨论中心对称矩阵的嵌入问题，该类矩阵是链对称模型中所出现矩阵的更高阶推广。这些模型刻画了由 DNA 双螺旋结构产生的替换对称性。判定一个转移矩阵是否可嵌入，使我们能够知道观测到的替换概率是否与齐次连续时间替换模型（如 Kimura 模型、Jukes-Cantor 模型或一般时间可逆模型）一致。另一方面，向高阶矩阵的推广受合成生物学背景的推动，后者使用不同大小的遗传字母表。
引用
@article{arxiv.2202.05889,
title = {Embeddability of centrosymmetric matrices capturing the double-helix structure in natural and synthetic DNA},
author = {Muhammad Ardiyansyah and Dimitra Kosta and Jordi Roca-Lacostena},
journal= {arXiv preprint arXiv:2202.05889},
year = {2022}
}
备注
34 pages, 9 tables