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电子附着于 DNA:氨基酸的保护作用

化学物理 2023-04-26 v1

摘要

我们以胞嘧啶为模型体系,研究了氨基酸对 DNA 核碱基电子附着性质的影响。采用扩展基组的运动方程耦合簇理论模拟了 DNA 模型体系的电子附着态。考虑了精氨酸、丙氨酸、赖氨酸和甘氨酸这四种组蛋白主要组分氨基酸,以探究其在电子附着 DNA 核碱基中的作用。在所有胞嘧啶-氨基酸二聚体复合物中,电子向胞嘧啶的附着遵循门户机制,即电子通过电子与核自由度的混合,从初始的偶极束缚门户态转移到最终的核碱基束缚态。在较高氨基酸浓度下,氨基酸束缚态充当门户态,初始电子密度定域于远离核碱基的氨基酸上。这导致核碱基对入射额外电子的物理屏蔽。同时,氨基酸的存在可增强核碱基束缚阴离子态的稳定性,从而抑制解离性电子附着诱导的糖-磷酸键断裂。

关键词

引用

@article{arxiv.2209.04865,
  title  = {Electron Attachment to DNA: The Protective Role of Amino Acids},
  author = {Pooja Verma and Achintya Kumar Dutta},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2209.04865},
  year   = {2023}
}