微管生长与灾难的动力学
定量方法
2008-04-23 v2 统计力学
生物物理
生物大分子
摘要
我们研究了一个简单的微管动力学模型,其中微管通过以下方式演化:(i) 鸟苷三磷酸 (GTP) 以其末端速率 lambda 附着,(ii) GTP 以速率 1 不可逆地转化为鸟苷二磷酸 (GDP),以及 (iii) GDP 以速率 mu 从微管末端脱离。作为这些基本速率的函数,微管可以稳定生长或其长度剧烈波动。我们发展了主方程方法来刻画这些引人注目的特征。对于 mu=0,我们找到了微管与 GTP 帽长度分布的精确表达式,以及 GTP 和 GDP 岛的长度幂律分布。对于 mu=∞,我们找到了微管收缩至零长度的灾难之间的平均时间,并将此方法推广以确定雪崩(连续的 GDP 脱离事件序列)的大小分布。我们得到了一般速率下的相图,并通过数值模拟验证了我们的预测。
引用
@article{arxiv.q-bio/0703001,
title = {Dynamics of Microtubule Growth and Catastrophe},
author = {T. Antal and P. L. Krapivsky and S. Redner and M. Mailman and B. Chakraborty},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0703001},
year = {2008}
}
备注
12 pages, 6 figures, 2-column revtex4; version 2: published version for PRE; contains various small changes in response to referee comments