焦磷酸测序中阳性信号的分布
基因组学
2024-05-28 v1 离散数学
组合数学
统计计算
摘要
焦磷酸测序是重要的下一代测序技术之一。我们推导了该测序技术焦磷酸图谱中阳性信号数量的分布,将其表示为流循环数和目标序列核苷酸概率的函数。关于序列长度分布,我们也推导了固定流循环模型下的阳性信号分布。文中得出了这些分布均值和方差的显式公式。关于分布均值的一个简单结果是:无论核苷酸概率如何,焦磷酸图谱中的平均阳性信号数约为流循环数的两倍。这些统计分布将有助于焦磷酸测序及其他相关平台的仪器和软件开发。
引用
@article{arxiv.1411.2549,
title = {Distributions of positive signals in pyrosequencing},
author = {Yong Kong},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.2549},
year = {2024}
}
备注
19 pages, 2 figures