区分差异易感性、素质-应激与优势敏感性:超越单基因单环境模型
应用统计
2018-08-22 v3
摘要
当前,在基因型×环境交互(GxE)研究中区分差异易感性与素质-应激及优势敏感性存在两种主要方法:显著性区域(RoS)与竞争-验证法。鉴于多数表型是多个相互作用的遗传与环境因子的产物,二者均受限于其单基因/单环境焦点。因此我们针对最近开发的 R 包(LEGIT)所解决这两点关切,该包利用交替优化构建具有潜在遗传与环境分数的 GxE 交互模型。在此,我们通过计算机模拟,在单基因单环境与多基因多环境背景下检验多样的 GxE 模型。结果表明,当样本量大时 RoS 与竞争-验证法均高度准确,而后者在小样本与小效应量时表现更优。验证法一般在(a)效应量中等且 N >= 500 与(b)效应量大且 N >= 250 时具有良好准确性,而 RoS 表现不佳。用于将多基因多环境的 GxE 类型判定的计算工具已作为扩展提供于我们的 LEGIT R 包中。
引用
@article{arxiv.1712.04058,
title = {Distinguishing differential susceptibility, diathesis-stress and vantage sensitivity: beyond the single gene and environment model},
author = {Alexia Jolicoeur-Martineau and Jay Belsky and Eszter Szekely and Keith F. Widaman and Michael Pluess and Celia Greenwood and Ashley Wazana},
journal= {arXiv preprint arXiv:1712.04058},
year = {2018}
}