病例对照研究中利用基因-环境独立性检测基因(G)-环境(E)加性交互作用的通用方法
统计方法学
2018-08-21 v1
摘要
在统计遗传学中，通过检验加性GxE交互作用的存在来检验遗传(G)与环境(E)危险因素之间机制交互作用的存在日益受到关注。在涉及罕见病的病例对照研究中，无加性交互作用的统计检验通常需要进行无交互作用相对超额风险(RERI)的检验。同样众所周知的是，利用G-E独立性的乘性交互作用检验，对于病例对照数据可比标准logistic回归具有显著更高的功效。此外，最近研究表明，纳入G-E独立性假设的无RERI似然比检验(RERI-LRT)优于标准RERI方法。本文中，作者描述了一种通用且相对简便的利用G-E独立性检验GxE加性交互作用的方法。该方法依赖于G和E的回归模型，尤其具有吸引力，因为与RERI-LRT不同，它允许二元结局的回归模型保持无限制。因此，新方法论对结局回归中可能的误设定完全稳健。这对于RERI-LRT不易处理的情形尤为重要，例如当E为计数或多组分连续暴露，或回归模型中存在若干辅助协变量时。尽管所提方法避免了拟合结局回归，它仍允许直接的协变量调整。方法通过广泛的模拟研究以及一项卵巢癌实证应用加以说明。
引用
@article{arxiv.1808.06038,
title = {A general approach to detect gene (G)-environment (E) additive interaction leveraging G-E independence in case-control studies},
author = {Eric J. Tchetgen Tchetgen and Xu Shi and Tamar Sofer and Benedict H. W. Wong},
journal= {arXiv preprint arXiv:1808.06038},
year = {2018}
}