使用RGxEStat进行基因-环境互作的显著性与稳定性分析
计算机视觉与模式识别
2026-04-21 v1 应用统计
摘要
基因型与环境互作（GxE）影响基因型在不同环境中的表现，降低了目标环境中表型的可预测性。深入分析GxE互作有助于识别遗传优势或缺陷如何在特定环境条件下表达或抑制，从而促进遗传选择并改进育种实践。本文介绍了GxE互作研究的两个关键模型。具体而言，包括基于混合效应模型的显著性分析，以确定基因或GxE互作是否显著影响表型性状；以及稳定性分析，进一步探究基因与环境之间的交互关系，以及基因型在不同环境中的相对优劣。此外，本文介绍了RGxEStat，一个由作者开发的轻量级交互工具，它集成了上述模型的构建、求解和可视化。RGxEStat旨在消除育种家和农学家学习复杂SAS或R编程的需要，为简化的育种数据分析提供了一个用户友好的界面，显著加速了研究周期。代码和数据集可在https://github.com/mason-ching/RGxEStat获取。
引用
@article{arxiv.2604.03337,
title = {Significance and Stability Analysis of Gene-Environment Interaction using RGxEStat},
author = {Meng'en Qin and Zhe Li and Xiaohui Yang},
journal= {arXiv preprint arXiv:2604.03337},
year = {2026}
}