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两类随机变量的离散度:一般理论及在细胞推断外部配体浓度中的应用

统计力学 2015-10-13 v2 生物物理

摘要

我们推导了马尔可夫过程中两类随机变量的离散度表达式。诸如电流和活度之类的随机变量属于第一类,该类由随机轨迹发生跳跃时即改变的随机变量组成。第二类对应于轨迹在某一状态(或状态簇)中停留的时间。虽然第一类的表达式可直接由文献中的已知结果得出,但我们证明类似的形式体系可用于推导第二类的表达式。作为一个应用,我们利用这一形式体系分析了估计外部配体浓度的细胞双组分网络。通过监测与内部蛋白质相关的不同随机变量,计算了与该外部浓度相关的不确定性。我们表明,除其他外,仅当存在耗散时,监测蛋白质磷酸化状态所花费的时间才会导致有限的不确定性,而从内部蛋白质跃迁活度获得的不确定性即使在平衡时也能达到 Berg 和 Purcell 极限。

关键词

引用

@article{arxiv.1505.07652,
  title  = {Dispersion for Two Classes of Random Variables: General Theory and Application to Inference of an External Ligand Concentration by a Cell},
  author = {Andre C. Barato and Udo Seifert},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1505.07652},
  year   = {2015}
}

备注

9 pages, 7 figures