从多重共病网络厘清个体疾病的遗传与环境影响因素
分子网络
2016-06-01 v1 物理与社会
应用统计
摘要
大多数疾病由多种遗传和/或环境因素共同引起。如果两种疾病由相同分子机制引起，它们往往在同患者中共现。本文提供一种定量方法，分别厘清遗传或环境影响因素对358种个体疾病发病机制的贡献程度。我们汇集了关于遗传、基于通路和毒理基因组学的致病机制数据，以及从近两百万患者获得的疾病共现数据。根据这些数据，我们构建了一个多层网络，其中节点表示疾病，链接要么表示患者的表型共病，要么表示某种分子机制的参与。通过每种疾病的表型网络与基于机制的网络之间的相似性，我们导出一种度量，得以量化给定疾病中各种分子机制的相对重要性。我们发现大多数疾病由遗传风险因素主导，而环境影响在抑郁症、癌症或皮炎等疾病中占优势。我们几乎从未发现超过一种机制类型参与疾病发病。
引用
@article{arxiv.1605.09535,
title = {Disentangling genetic and environmental risk factors for individual diseases from multiplex comorbidity networks},
author = {Peter Klimek and Silke Aichberger and Stefan Thurner},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.09535},
year = {2016}
}