模拟复杂疾病中基因-环境相互作用的新方法
定量方法
2009-05-08 v1 种群与进化
摘要
复杂疾病是由遗传和环境因素共同作用引起的多因素性状。它们代表了人类疾病的大部分，包括那些患病率和死亡率最高的疾病（癌症、心脏病、肥胖症等）。尽管已经收集了大量关于遗传和环境风险因素的信息，但在流行病学文献中，关于它们相互作用的研究实例相对较少。一个原因可能是对旨在搜索这些数据集中风险因素及其相互作用的统计方法功效的了解不完整。在这一方向上的改进将有助于更好地理解和描述基因-环境相互作用。为此，一种可能的策略是让不同的统计方法面对那些潜在现象完全已知且完全可控的数据集，例如模拟数据集。我们提出了一种模拟基因-环境相互作用的数学方法。通过这种方法，可以生成具有任何形式基因-环境相互作用的模拟群体。我们在一个基因-环境相互作用模拟器（GENS）中实现了该模型的一个简单版本，该工具旨在模拟病例-对照数据集，其中单个基因-单个环境的相互作用影响疾病风险。主要工作是允许用户使用标准流行病学测量来描述群体特征，并实施约束以使模拟器的行为具有生物学意义。
引用
@article{arxiv.0905.0994,
title = {A novel approach to simulate gene-environment interactions in complex diseases},
author = {Roberto Amato and Michele Pinelli and Daniel D'Andrea and Gennaro Miele and Mario Nicodemi and Giancarlo Raiconi and Sergio Cocozza},
journal= {arXiv preprint arXiv:0905.0994},
year = {2009}
}