环状病毒是否介导了蝙蝠与穿山甲冠状病毒的重组从而产生 SARS-CoV-2?
基因组学
2020-10-02 v1
摘要
自中国湖北省武汉市报告由严重急性呼吸综合征病毒(SARS-CoV-2)引起的 2019 冠状病毒病(COVID-19)以来,科学家们一直在争分夺秒地寻找关于其起源的可靠答案。尽管关于 SARS-CoV-2 的科学文章数量不断增加,但其起源仍存在许多空白。所有研究都未能在其他动物中找到比被认为是主要宿主的蝙蝠病毒更类似于人类 SARS-CoV-2 的冠状病毒。本文基于 DNA 病毒与 SARS-CoV 病毒之间可能发生重组的假设,提出一种新的假说以解释 SARS-CoV-2 的出现。通过比较 SARS-CoV-2 及相关冠状病毒(CoVs)与环状病毒(CVs),我们发现蝙蝠冠状病毒(Bat-CoV)ORF1a 的 3' 端基因组区域与 2 型猪环状病毒(PCV2)复制起点(Ori)具有强烈的序列相似性,并且涵盖冠状病毒 S 基因切割位点的区域与 PCV2 Ori 具有相似的 RNA 二级结构。这构成了支持可能发生重组的首要证据,该重组事件的发生或可解释 SARS-CoV-2 的起源。
引用
@article{arxiv.2010.00531,
title = {Did circoviruses intermediate the recombination between bat and pangolin coronaviruses, yielding SARS-CoV-2?},
author = {Nabil Abid and Giovanni Chillemi and Ahmed Rebai},
journal= {arXiv preprint arXiv:2010.00531},
year = {2020}
}
备注
18 pages, 4 figures