配体与疏水口袋结合的去润湿控制机制
软凝聚态物质
2009-11-17 v1
摘要
我们报道了对一个通用疏水口袋-配体（主-客）系统进行的原子分子动力学模拟与隐式溶剂分析的结合研究。靠近的配体在弱溶剂化口袋中诱发了复杂的润湿/去润湿转变。该转变导致了双峰溶剂涨落，后者决定了口袋-配体吸引力的幅度与范围。一种最近开发的基于几何泛函最小化的隐式水模型，半定量地捕捉到了敏感的水界面响应于凹凸口袋-配体构型的变化。
引用
@article{arxiv.0911.2970,
title = {Dewetting-controlled binding of ligands to hydrophobic pockets},
author = {P. Setny and Z. Wang and L. -T. Cheng and B. Li and J. A. McCammon and J. Dzubiella},
journal= {arXiv preprint arXiv:0911.2970},
year = {2009}
}